Der größte Unterschied zwischen einem stationären (Desktop-)Computer und einem Notebook liegt auf der Hand: Während der Desktop-Computer nur ortsgebunden eingesetzt werden kann und mit größerem Aufwand transportiert werden kann, trifft das für das Notebook natürlich nicht zu. Ein Notebook ist per se ein portabler Computer, der seinem Nutzer den Vorteil der Flexibilität und der Einsetzbarkeit an fast jedem denkbaren Ort bietet. Während der Desktop-Computer auf einen ständigen Stromanschluss angewiesen ist, um zu funktionieren, ist das bei einem Notebook nicht der Fall. Der verbaute Akku macht das Gerät unabhängig von einer Stromquelle und erhöht den Einsatzradius des Computers damit erheblich. Moderne portable Computer wie beispielsweise ein Acer Notebook, verfügen mittlerweile (abhängig von den verwendeten Anwendungen) über Akkulaufzeiten von drei und mehr Stunden.
Ein Notebook ist im Allgemeinen jedoch störanfälliger als ein Desktop-Rechner. Dies liegt nicht etwa daran, dass Notebooks unausgereifte Produkte wären, sondern ist in der Verwendung der Geräte begründet. Im Gegensatz zu einem Desktop-Rechner wird ein Notebook viel öfter bewegt, womit die Gefahr besteht, dass es Schaden nimmt. Tatsächlich sind Notebooks für den mobilen Einsatz konzipiert und in diesem Zusammenhang ist die Störanfälligkeit der Geräte in den letzten Jahren drastisch gesunken. Jedoch ist die Wahrscheinlichkeit, mit dem Gerät irgendwo anzustoßen oder es vielleicht unabsichtlich vom Tisch zu fegen und dabei zu beschädigen, viel größer als bei einem Desktop-Rechner.
Allein aufgrund der Bauart ist in der Regel davon auszugehen, dass Desktop-Rechner um einiges leistungsstärker als Notebooks sind. Dies ist einerseits der stärkeren und permanenten Stromversorgung und andererseits natürlich auch dem verfügbaren Platz geschuldet. Ein Notebook verfügt über erheblich weniger Platz als ein Desktop-Rechner, so das beispielsweise aufwändige Kühlsystem für Hochleistungsprozessoren nur schwerlich Platz finden würden. Und damit können natürlich auch keine Hochleistungsprozessoren verbaut werden, welche an die Leistungskapazitäten von Desktop-Rechner heran reichen würden.